در "ماموریت کماندو" یک سرباز تفنگدار در مراحل مختلف اقدام به پاکسازی مناطق اشغال شده توسط  سربازان دشمن مینماید. کماندو داستان با اسلحه‌های مختلف اقدام به کشتن دشمنان می‌کند.