فیلم افسانه فاتحان طوفان، داستان دو جوان شورشی است که سیصد سال پس از «سیل بزرگ»، در جهانی پوشیده از آب و جزایر پراکنده زندگی می‌کنند. آن‌ها با الهام از افسانه یک طوفان‌سوار، راهی سفری خطرناک به دل طوفانی بی‌پایان می‌شوند تا راز پیدایش جهان خود و حقیقتی را که حاکمان جاودانه از مردم پنهان کرده‌اند، آشکار کنند.