طبق توصیه های دامپزشکی، داروهای رایج دام در دامداری و کشاورزی ارگانیک مجاز است اما داروهای جایگزین ترجیح داده می‌شود. پیشگیری از بیماری با مصرف مواد مخدر ممنوع است و می‌توان از آنتی بیوتیک ها در مدت زمان محدود و با زمان برداشت دو برابر استفاده کرد. مراقبت های بهداشتی حیوانات هنوز به اندازه کافی توسعه نیافته اند که بتوانیم دام ها را بدون داروهای رایج دام در دامپزشکی سالم نگه داریم. در اروپا و ایالات متحده پیشرفت های زیادی در زمینه استفاده از داروهای دامپزشکی هومیوپاتی انجام شده است که در بسیاری از موارد کاربرد آن در برخی از مشکلات بهداشتی را نشان داده است. در آفریقا نیز از محلول های قارچی استفاده می‌شود و در مواردی که با یک گیاه شناس باتجربه مشورت شود، تا حدی ممکن است مؤثر باشد. بخش عمده ای از این موارد به خوبی اثبات نشده و تأیید نشده است، اما بسیاری از دامداران از نتایج خوب آن استفاده می کنند.