داستان سالهای کودکی قهرمانان ماداگاسکار الکس شیر، مارتی گورخر، ملمان زرافه و گلوریا اسب. آنها در یک زیستگاه امداد در باغ وحش پارک مرکزی بزرگ می شوند.